MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 146288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_002678	CGT	2	6	195266	195271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470542
4003	NC_002678	TC	3	6	195275	195280	0 %	50 %	0 %	50 %	13470542
4004	NC_002678	GAA	2	6	195288	195293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470542
4005	NC_002678	GGC	2	6	195339	195344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470542
4006	NC_002678	TCG	2	6	195346	195351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470542
4007	NC_002678	TGA	2	6	195385	195390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470542
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4009	NC_002678	ACG	3	9	195478	195486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470542
4010	NC_002678	GC	3	6	195539	195544	0 %	0 %	50 %	50 %	13470542
4011	NC_002678	GCC	2	6	195600	195605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470542
4012	NC_002678	CGC	2	6	195615	195620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470542
4013	NC_002678	GGC	2	6	195621	195626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470542
4014	NC_002678	TCG	2	6	195628	195633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470542
4015	NC_002678	GACGC	2	10	195642	195651	20 %	0 %	40 %	40 %	13470542
4016	NC_002678	CG	3	6	195663	195668	0 %	0 %	50 %	50 %	13470542
4017	NC_002678	TGA	2	6	195715	195720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470542
4018	NC_002678	CAA	2	6	195788	195793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470542
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4021	NC_002678	CGA	2	6	195929	195934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470542
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4024	NC_002678	GGA	2	6	195998	196003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470542
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4030	NC_002678	CGT	2	6	196238	196243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470542
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4032	NC_002678	GAG	2	6	196308	196313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470542
4033	NC_002678	CGA	3	9	196337	196345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470542
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4035	NC_002678	TCG	2	6	196393	196398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470542
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4044	NC_002678	GTGTC	2	10	196717	196726	0 %	40 %	40 %	20 %	13470542
4045	NC_002678	CTGGG	2	10	196845	196854	0 %	20 %	60 %	20 %	13470542
4046	NC_002678	AAG	2	6	196872	196877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470542
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4054	NC_002678	CTCG	2	8	197249	197256	0 %	25 %	25 %	50 %	13470542
4055	NC_002678	CAG	2	6	197262	197267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470542
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4062	NC_002678	CGA	2	6	197528	197533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470542
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4080	NC_002678	CAT	2	6	198571	198576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470543
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4090	NC_002678	AAGGC	2	10	199032	199041	40 %	0 %	40 %	20 %	13470543
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4093	NC_002678	GC	3	6	199191	199196	0 %	0 %	50 %	50 %	13470543
4094	NC_002678	ATC	2	6	199199	199204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470543
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4097	NC_002678	ATC	2	6	199424	199429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470543
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4102	NC_002678	TGCCG	2	10	199595	199604	0 %	20 %	40 %	40 %	13470543
4103	NC_002678	TTCG	2	8	199609	199616	0 %	50 %	25 %	25 %	13470543
4104	NC_002678	GAC	2	6	199622	199627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470543
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4107	NC_002678	GTC	2	6	199742	199747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470543
4108	NC_002678	CGA	2	6	199780	199785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470543
4109	NC_002678	GAT	2	6	199786	199791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470543
4110	NC_002678	ATG	2	6	199856	199861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470543
4111	NC_002678	CCCA	2	8	199886	199893	25 %	0 %	0 %	75 %	13470543
4112	NC_002678	ATC	2	6	199961	199966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470543
4113	NC_002678	AAGG	2	8	199976	199983	50 %	0 %	50 %	0 %	13470543
4114	NC_002678	TCG	2	6	200160	200165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470543
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4116	NC_002678	CGA	2	6	200221	200226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470543
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4118	NC_002678	GC	3	6	200396	200401	0 %	0 %	50 %	50 %	13470543
4119	NC_002678	GGT	2	6	200512	200517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470543
4120	NC_002678	CCT	2	6	200538	200543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470543
4121	NC_002678	CCGCAA	2	12	200563	200574	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13470543
4122	NC_002678	GTG	2	6	200576	200581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470543
4123	NC_002678	CAG	2	6	200597	200602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470543
4124	NC_002678	CGA	2	6	200638	200643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470543
4125	NC_002678	GC	3	6	200656	200661	0 %	0 %	50 %	50 %	13470543
4126	NC_002678	CCCG	2	8	200754	200761	0 %	0 %	25 %	75 %	13470543
4127	NC_002678	CGA	2	6	200833	200838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470543
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4153	NC_002678	CTG	2	6	202255	202260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470544
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4155	NC_002678	GAA	2	6	202278	202283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470544
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4240	NC_002678	CGA	3	9	206736	206744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470549
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4242	NC_002678	TCG	2	6	206786	206791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470549
4243	NC_002678	ACA	2	6	206849	206854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470549
4244	NC_002678	AAG	2	6	206866	206871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470549
4245	NC_002678	TGC	2	6	206888	206893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470549
4246	NC_002678	ATGC	2	8	206896	206903	25 %	25 %	25 %	25 %	13470549
4247	NC_002678	CG	3	6	206909	206914	0 %	0 %	50 %	50 %	13470549
4248	NC_002678	GAA	2	6	206923	206928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470549
4249	NC_002678	TCG	2	6	206945	206950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470549
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4253	NC_002678	CAT	2	6	207201	207206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470549
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4267	NC_002678	A	6	6	207886	207891	100 %	0 %	0 %	0 %	13470549
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4274	NC_002678	CGA	2	6	208375	208380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470531
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4278	NC_002678	GCTG	2	8	208477	208484	0 %	25 %	50 %	25 %	13470531
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4294	NC_002678	TCG	2	6	209121	209126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470531
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4299	NC_002678	TCG	2	6	209439	209444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470550
4300	NC_002678	TGA	2	6	209472	209477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470550
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4302	NC_002678	CGTCGA	2	12	209497	209508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	13470550
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4310	NC_002678	TCG	2	6	209887	209892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470551
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4322	NC_002678	AAT	2	6	210292	210297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13470551
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4326	NC_002678	CGT	2	6	210397	210402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470552
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4334	NC_002678	CT	3	6	210630	210635	0 %	50 %	0 %	50 %	13470552
4335	NC_002678	GGCCAA	2	12	210637	210648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470552
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4350	NC_002678	A	6	6	211238	211243	100 %	0 %	0 %	0 %	13470554
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4354	NC_002678	CGG	2	6	211390	211395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470554
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4357	NC_002678	ACCGC	2	10	211485	211494	20 %	0 %	20 %	60 %	13470554
4358	NC_002678	GAT	2	6	211517	211522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470554
4359	NC_002678	CAT	2	6	211537	211542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470554
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4361	NC_002678	TGGC	2	8	211578	211585	0 %	25 %	50 %	25 %	13470554
4362	NC_002678	TCG	2	6	211719	211724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470554
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4366	NC_002678	CGG	2	6	211924	211929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470554
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4488	NC_002678	AGC	2	6	216976	216981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470566
4489	NC_002678	CAAGGG	2	12	217034	217045	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	13470566
4490	NC_002678	CGTT	2	8	217046	217053	0 %	50 %	25 %	25 %	13470566
4491	NC_002678	AAGG	2	8	217077	217084	50 %	0 %	50 %	0 %	13470566
4492	NC_002678	AAG	3	9	217086	217094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470566
4493	NC_002678	CAT	2	6	217228	217233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470567
4494	NC_002678	CGC	2	6	217274	217279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470567
4495	NC_002678	GAA	2	6	217333	217338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470567
4496	NC_002678	CGA	2	6	217357	217362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470567
4497	NC_002678	TGC	2	6	217381	217386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470567
4498	NC_002678	CCG	5	15	217440	217454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470567
4499	NC_002678	GC	3	6	217477	217482	0 %	0 %	50 %	50 %	13470567
4500	NC_002678	GTC	2	6	217505	217510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470567

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